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报岁兰转录组de novo及DGE

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中科院华南植物园项目

(一)转录组组装质量评估

(二)特定(与开花相关)unigene

分析结果:根据转录组注释结果,我们发现有120条unigene与花期相关;有73条MADS-box unigene;有28条CONSTANS-like unigene。

(三)DGE样本差异表达分析

分析结果:

VP (vegetative phase):营养期报岁兰

FDP (floral differentiation phase):花分化期报岁兰

RP (reproductive phase):繁殖期报岁兰

(四)与花发育有关基因分析及qRT-PCR验证

结果分析:

营养期和花分化期样本聚类关系较近,繁殖期样本聚类关系较远,这与三者基因表达差异情况是较为一致的

用于聚类的32个unigene与花的发育相关

qRT-PCR结果一致

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