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致命鹅膏子实体转录组de novo

华南理工大学生物科学与工程学院项目

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(一)转录组组装质量评估

(二)毒素及相关多肽的基因及其序列

分析结果:左图所示为找出的毒素及其相关多肽的基因的序列信息(A为转录组得到的序列,含7条未知序列;B为PCR扩增的序列,含三条未知序列),右图为三种毒素的蛋白序列不同区域比较

(三)致命鹅膏与3个近缘物种的鹅膏覃碱α、β及类鬼笔环肽的编码序列与多肽原蛋白序列的比对

(四)鹅膏多肽原蛋白序列的进化树分析

结果分析:根据鹅膏多肽基因间的距离确定演化关系并绘制进化树图,不同的颜色表示不同的物种。从中可以看出各基因的相似性层级归类。

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