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猪骨骼肌miRNA组学协同研究

中山大学生命科学学院项目

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(一)各样品测序所得reads的成分分析

如图所示。

A图表示10个样品的reads长度分布。

B图表示10个样品总reads的注释结果在长度上的分布。

C图:左图为10各样品的总reads的注释结果统计,右图为唯一比对的reads的注释结果统计。

(二)各样品miRNA组的表达量及功能分析

(三)差异表达的miRNA在样品间的分布统计

(四)miRNA Target Genes的KO分析

分析结果:图A是全部样品的miRNA靶基因的KEGG显著性富集结果,图B为三个阶段里的KEGG显著性富集结果。从图中可以得到miRNA疑似调控的基因在骨骼肌生长的不同阶段中主要参与了那些功能。

(五)差异表达的miRNA趋势分析

分析结果:使用STEM软件对差异表达的miRNA进行了趋势分析:

A表示在骨骼肌纤维组装过程(35dpc~77dpc)共4个样品中差异表达的miRNA聚类,有3个趋势显著;

B表示在骨骼肌纤维成熟过程(77dpc~180dpn)共6个样品中差异表达的miRNA聚类,有2个趋势显著。

(六)候选肌原性miRNAs 表达模式聚类

分析结果:与肌纤维相关miRNAs有相同的表达模式的差异表达miRNAs被找出并聚类为6类。该图展示了各类共25个miRNA在10个样品中的均一化表达量。

(七)qPCR验证

分析结果:对10个样品大量表达的随机9个miRNA的表达量进行qPCR验证,图中只列出了2个miRNA作为说明。

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