白菜网送体验金2018

冬瓜转录组denovo 报岁兰转录组denovo及DGE 致命鹅膏子实体转录组denovo 猪骨骼肌miRNA组学协同研究 棉铃虫免疫致敏现象的相关基因研究 互交杂种蓖麻籽胚乳的基因组印迹、甲基化与亲源效应研究 南瓜转录组De novo及标记开发 玉米穗发育相关的miRNA及靶基因研究 灯盏花转录组分析揭示假定的野黄芩苷和绿原酸生物合成基因及其遗传标记 荔枝Sonn的叶组织转录组从头组装 通关藤氧孕烷合成基因发现及标记开发 入侵种福寿螺与本地种田螺的比较转录组研究 卵形鲳鲹的繁殖、生长以及免疫相关基因的转录组分析 Si-CSP9基因在红色红火蚁外皮形成和蜕皮过程中的调控作用 植物激素对非洲菊花瓣发育的转录组调控 高低聚糖食品导致瘦小鼠更大体重增长 苹果小RNA文献解读 铁皮石斛转录组分析 与其在鉴定多糖合成相关基因中的应用 浮萍响应高浓度铵盐转录组分析 不同品系小白菜镉胁迫转录组比较分析 乳腺间质成纤维细胞在患乳腺炎奶牛中表现出的炎症特异性变化 玉米转录因子导入拟南芥研究镉离子胁迫耐受机制 蓖麻胚乳型种子基因组DNA甲基化 通过抑制EZH2恢复IKKa的表达促进了鼻咽癌细胞的分化 利用选择压力分析策略研究山羊群体进化 CHIP-SEQ助力脱髓鞘分子机制研究 番荔枝花发育的转录调控研究 月季成花转变的转录调控研究 泛素化介导花瓣衰老机制研究
分享到:

月季成花转变的转录调控研究

 

发表杂志:《BMC Genomics》    影响因子:3.867

文章下载链接:/uploads/tmp/genedenovo-resume-1490163874.3877563.pdf

取    材
月季三个成花转变阶段(VM、TM、FM)的茎顶端分生组织旁的叶子,每组三个重复,共9个样本。

•结    果
1、代谢物含量变化
(1)糖和淀粉
糖的含量从VM到TM阶段上升,但从TM到FM阶段下降;淀粉含量从VM到FM阶段一直下降。

(2)植物激素
检测了生长素(Aux)、ABA、GA的浓度:

2、转录组结果
共鉴定出1637个差异表达基因,其中32个基因与生物钟、糖代谢、植物激素、自发通路相关(如下图)。

3、代谢物与转录组数据联合分析
(1)糖代谢
糖生物合成和转运信号通路上的基因的表达趋势与糖含量的变化趋势一致,都表现为从VM到TM阶段上升,从TM到FM阶段下降,说明糖类物质可能是成花转变的一个信号,可调控开花相关基因如SOC1,AP1的表达。

(2)淀粉代谢
淀粉含量在成花转变阶段逐渐下降,而淀粉合成基因如SS1-4,GSSS1,THI1等的表达量在VM到TM阶段上升,在TM到FM阶段又稍稍下降,说明在成花转变的过程中淀粉消化为蔗糖的速率加快。另外,两个淀粉降解基因AMY和BAM1的表达量在VM阶段到TM阶段上升,说明充足的可溶性糖在成花转变过程中的必须的。

(3)生长素auxin
生长素的浓度和生长素相关基因(生长素结合蛋白ABP、生长素反应因子ARF等)的表达在成花转变过程中都逐渐升高。表明生长素可促进成花转变。

(4)赤霉素GA
GA1,GA3,GA4的浓度在月季花从VM到TM阶段的转变中快速下降,同时GA合成基因如CPS,KO,GA20ox1,GA3ox的表达量也下调了,而催化活性GA为非活性形式的基因GA2ox的表达量上升,这说明GA在月季成花转变过程中起着负调控的作用。

(5)脱落酸ABA
ABA在组织中的含量比其他植物激素都高,但从VM阶段到TM阶段浓度大幅下降,同时ABA合成基因NCED和受体基因PYL,PYR的表达量也显著下调,说明ABA信号通路在月季成花转变过程中起着抑制的作用。

留言