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RNA芯片服务

 RNA表达谱芯片服务

芯片名称:Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array 
详细介绍: 此款芯片包含了47,000个转录本,代表了38,500个明晰的人类基因。数据库来源于GeneBank、dbEST、RefSeq、The sequence clusters在 UniGene database(Build 159 January 25 2003)创建,并通过Washington University EST trace repository和California大学、Santa Cruz Golden-Path人类基因组数据库(April 2001 release)分析比对。此外,有9,921新probe sets代表6500个新基因,这些基因序列来源于GenBank, dbEST, and RefSeq,Sequence clusters在 UniGene database (Build 159, January 25, 2003)创建,并通过Washington大学EST trace repository 和NCBI human genome assembly(Build 31) 分析比对。

芯片推荐:GeneChip Human Transcriptome and Splice Junction Array 
详细介绍:Affymetrix 新近推出的人类转录组和剪接体分析芯片(Human Transcriptome and Splice Junction Array),又称GG-H芯片(Glue Grant Human Transcriptome Array,GG-H),是Affymetrix联合Stanford大学和NIH的Glue Grant项目,共同研发的一种基于全新设计理念的芯片。这种芯片针对人类转录组全方位检测的需要,分别对外显子和外显子连接区设计探针,可同时用于基因表达、替代性剪接和编码区SNPs检测;另外,该芯片还收录了大量非编码RNA片段,可用于非编码RNA转录的检测。

芯片推荐:GeneChip Human Exon 1.0ST Array  
详细介绍:Affymetrix全转录本表达谱芯片产品,约有4个探针来针对每个外显子,约有40个探针来针对每个基因,覆盖经验性及预测的外显子序列。

芯片推荐:GeneChip Human Gene 1.0ST Array  
详细介绍:该表达谱芯片覆盖人全转录本;每个基因用大约25个探针来检测,检测28,869个功能明确基因的表达情况。

芯片推荐:Affymetrix Human Genome U219 Array Plate
芯片介绍:该款芯片可以同时针对96个样品机型高通量的表达谱研究。可对36,000个以上的转录本和变异体进行精确的表达谱检测;每个转录本的表达情况都是通过多重独立反应来完成检测工作的,从而获得具有高精确性以及重复性的基因表达数据。数据来源于UniGene database219(2009年3月30日公布)、RefSeq version36(2009年7月13日公布)以及GeneBank中的全长人类mRNA(2009年5月12日)。
适用仪器:Gene Titan自动化芯片工作站

芯片推荐:Affymetrix GeneChip HT HG-U133+ PM Array Plate
芯片介绍:该款芯片使用Affymetrix GeneTitan系统进行检测,可同时自动处理24或96个样品,芯片信息与Affymetrix 人U133 Plus 2.0芯片相同。
适用仪器:Gene Titan自动化芯片工作站

芯片推荐:Affymetrix GeneChip Human Gene 1.1ST Plate
芯片介绍:该款芯片使用Affymetrix GeneTitan系统进行检测,可同时自动处理24或96个样品,芯片信息与Affymetrix GeneChip Human Gene 1.0ST Array相同。
适用仪器:Gene Titan自动化芯片工作站
 

 miRNA芯片服务
  Affymetrix miRNA芯片在一张芯片上覆盖了多个物种,除了人、大小鼠外,还包括拟南芥、水稻、玉米等重要植物模式生物。
芯片名称:Affymetrix GeneChip miRNA 3.0
技术特点
※ 探针设计覆盖全面:全面覆盖miRNA v17数据库,检测153个物种的miRNA,同时可以检测snoRNA和scaRNA
※ 专一性设计:唯一一款能在一个试验中对miRNA前体和成熟miRNA进行有效区分的芯片
※ 超高的灵敏度:在1amol中能检测到94%的miRNA
※ 高度的可重复性:重复性高达0.95
※ 流程简便:45分钟完成整个实验操作,无需预扩增或纯化步骤
※ 起始样本量少:仅需130ng的总RNA即可得到满意的结果


产品介绍( 备注:Affymetrix miRNA芯片产品会根据Sanger miRBase数据库不定期更新,购买时请注意芯片版本。)

 lncRNA芯片服务

芯片名称:Affymetrix GeneChip Human  Transcriptome Array 2.0
Affymetrix最新开发的GeneChip? Human TranscriptomeArray 2.0芯片经过设计,可消除这些技术和分析限制。这一高分辨率芯片包含了超过六百万条不同探针,覆盖编码和非编码转录本。该芯片上70%的探针覆盖编码转录本的外显子,其余30%的探针覆盖外显子之间的剪接位点和非编码转录本。此芯片无以伦比的覆盖度带来了迄今为止最为深入的编码和非编码转录本研究。为了确保转录组的均一覆盖,GeneChip Human TranscriptomeArray 2.0芯片为每个外显子设计约10条探针,每个外显子之间的剪接点有4条探针。这一覆盖确保您每个实验都能获得完整、准确和可重复的数据。
GeneChip Human Transcriptome Array 2.0芯片的优点:
1、覆盖>285,000个全长转录本
※ >245,000个非编码转录本
※>40,000个编码转录本
※ >339,000个探针组,覆盖外显子之间剪接位点
2、多个来源的数据经过编辑和组织
※ 减少冗余的探针组
※ 制定目前最全面的基因模式
3、外显子水平分析的集成方案
※ 实验室流程与生物信息学分析无缝整合成一个解决方案
4、检测选择性剪接事件/转录本异构体
※ 探针旨在最大限度提高外显子覆盖度,让您能检测所有转录本异构体
5、对您的结果充满信心
※ 可重复:批内相关系数≥0.99
※ 所有检测过的组织观察到的变异系数(CV)<6.5%
6、临床和非临床样本都能获得有意义的结果
※ 包括FFPE样本(福尔马林固定石蜡包埋)和新鲜冻存样本
芯片参数: