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蛋白定量分析

蛋白定量分析是指在蛋白全谱分析的基础上,对单基因组样本或复杂的混合体系内我们所关注的蛋白质进行精确定量的分析方法,可用于对多个样本中的蛋白含量进行比较,寻找差异表达的蛋白,并评价其功能特点。

应用领域

多样本的蛋白质差异表达分析
蛋白调控网络研究

技术路线

分析内容

1. 标准信息分析
   a)  数据产出统计
   b)  蛋白质鉴定结果
   c)  蛋白质定量结果
   d)  蛋白质GO 分析
   e)  蛋白质COG 分析
   f)   蛋白质Pathway 代谢通路分析
   g)  差异蛋白的GO 富集分析
   h)  差异蛋白的Pathway 富集分析
   i)   多样品间表达模式聚类(三个或三个以上样品可提供)
2. 高级信息分析
   a)  蛋白质组与转录组/ RNA-Seq / DGE 关联分析
   b)  蛋白相互作用网络分析(部分物种可提供)
   c)  可结合客户的需求,协商确定其它定制化信息分析服务内容。
 

样品要求

1. 动物组织:要求干重不少于100 mg;
2. 植物组织和菌体:要求干重不少于2 g;
3. 细胞样品:要求细胞数大于5×106
4. 体液样品:全血要求5 ml 以上;血清/血浆要求500 μl 以上;尿液需50 ml 以上(送样前需1000g离心5min,弃去沉淀);其他体液(唾液、羊水、脑脊液等)要求5 ml 以上。为了避免溶血所致的蛋白干扰,一般不建议送全血;
5. 富含杂质或蛋白质含量低的样品(如植物的根、木质部、韧皮部组织等):要求干重不少于5 g,酌情考虑;
6. 蛋白质提取物:要求浓度不少于1 μg/μl,蛋白量不少于500 μg。
7. 肽段分析:消化前蛋白量不少于50μg。

项目周期

标准流程的运转周期约为55个工作日