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全基因组甲基化测序

Bisulfite(全基因组甲基化测序):利用Bisulfite(亚硫酸盐)对基因组进行处理后上机测序。应用领域:测序可精确到单个碱基的甲基化,能得到全基因组的甲基化位点信息,可用于全基因组DNA甲基化图谱制作;疾病关联分析;基因调控分析;疾病的甲基化标志物等。

应用领域

全基因组DNA甲基化图谱构建
基因调控分析

技术路线

分析内容

1. 标准信息分析
  a)   对测序数据进行base calling、raw data 数据整理及数据质量评估;
  b)   去接头污染,去低质量reads和产量情况统计
  c)   Bisulfite 测序序列与参考基因组序列的比对
  d)   深度和覆盖度分析
  e)   C 碱基的甲基化水平
  f)   全基因组甲基化水平分布趋势

 g)  全基因组DNA甲基化图谱

  h)  差异性甲基化区域(DMR)分析

 2. 高级信息分析
根据具体研究进行的细节分析

样品要求

样品类型:DNA 样品;
样品需求量:总量≥5μg,浓度≥50ng/μL;
样品完整性:DNA 无明显降解,需提供凝胶电泳检测胶图。

项目周期

单个样品标准流程(上图)的运转周期约为60个工作日,遇样品数较多时,项目周期根据项目规模而定。

参考文献

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